VISI
Unggul, terampil, inovatif, kompetitif dan berwawasan IPTEK berlandaskan IMTAQ

MISI
1. Menyelenggarakan pendidikan yang berkualitas dalam pencapaian prestasi akademik dan non akademik
2. Mewujudkan pembelajaran dan pembiasaan dalam menjalankan ajaran agama secara utuh
3. Mewujudkan pembentukan karakter umat yang mampu mengaktualisasikan diri dalam masyarakat
4. Meningkatkan pengetahuan dan profesionalisme tenaga kependidikan sesuai dengan perkembangan zaman
5. Menjadikan MAN KARIMUN sebagai madrasah model dalam pengembangan pembelajara IMTAQ dan IPTEQ
6. Menyelenggarakan tata kelola madrasah yang efektif, efisien, transparan dan akuntabel

TUJUAN
a. Peningkatan mutu akademik peserta didik seperti yang ditetapkan pada Standar Ketuntasan Minimal.

b. Terwujudnya kehidupan sekolah yang agamis dan berbudaya.

c. Peningkatan kemampuan siswa di dalam keagamaan.

d. Peningkatan kemampuan siswa dalam seni dan budaya.

e. Peningkatan kemampuan siswa dalam teknologi informasi dan komunikasi.

f. Terwujudnya lingkungan sekolah yang bersih, nyaman dan kondusif.

g. Peningkatan kelengkapan sarana dan prasarana menuju sekolah yang ideal.

h. Peningkatan kegiatan yang efektif, efesien berdaya guna untuk menumbuh kembangkan potensi peserta didik. 

i. Terwujudnya hubungan yang harmonis dan dinamis antar warga madrasah dan masyarakat.